Le principal problème posé par les méthodes d'immunodétection pour les champignons phytopathogènes est liéà la présence de très nombreuses protéines fongiques, dont certaines ne sont pas spécifiques de l'espèce. Aussi, chaque préparation fongique contient un nombre important d'antigènes parmi lesquels seuls quelques‐uns sont intéressants pour un diagnostic. Par quelques exemples, nous voulons illustrer les méthodes employées à l'INRA Versailles, où il a été décidé de concentrer les efforts sur une meilleure compréhension de la variabilité des protéines de champignons et d'utiliser des anticorps polyclonaux comme préliminaires à la production d'anticorps monoclonaux. Dans le cas dePeronospora viciaesur semences de pois, ou deVerticillium dahliaesur boutures de pélargonium, il n'y a qu'un pathogène du même genre présent dans la plante. Aussi, une grande spécificité n'est pas nécessaire, et il est facile de produire un bon antisérum détectant le mildiou du pois de semence ouV. dahliaedans les plantes, même si d'autres mildious ouVerticilliumréagissent avec l'antisérum. Si deux espèces proches d'un point de vue taxonomique sont présentes sur la même plante, par exempleSclerotinia sclerotiorumetBotrytis cinereasur pétales de colza, il est nécessaire d'éliminer les protéines non spécifiques par différents types d'absorption croisée. Si différentes espèces fongiques du même genre infectent la même plante, le problème est plus compliqué. Etudier et choisir des protéines spécifiques,