年代:1993 |
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Volume 110 issue 1‐6
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1. |
The value of accuracy in making selection decisions |
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Journal of Animal Breeding and Genetics,
Volume 110,
Issue 1‐6,
1993,
Page 1-12
H. M. Klieve,
B. P. Kinghorn,
S. A. Barwick,
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PDF (722KB)
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摘要:
SummaryA stochastic simulation was carried out to investigate the impact of using an index ofehvsand accuracy on genetic response and utility. Two population types were considered based on the range of accuracy used (Type A: 0–1.0 and B: 0.5–1.0). Five hundred replications were carried out leading to the evaluation of the sample mean response and its variance. The index weightings defining plateaux within 1% and 5% of the maximum response were identified, these suggesting that for population Types A and B, minimal loss in response will occur if weightings on accuracy of up to ± 0.5 σ and ± 1.5σ are selected. These weightings result in relatively minor changes in the ranking of animals, particularly where only a small number of animals are selected. Utility was defined as a function of the mean and variance of the sample response. The index weightings leading to the maximal utility were identified for seven utility functions (three risk averse, three risk preferring and a risk neutral function). Placing some weighting on accuracy when making selection decisions can be done with little compromise in expected mean response. This gives opportunity to reflect risk preferring or risk averse attitudes through the use of negative or positive weightings on accuracy. However, it seems that somewhat extreme utility functions are required before this opportunity can result in significant benefit.ZusammenfassungDer Wert von Genauigkeit bei SelektionsentscheidungenZur Untersuchung des Einflusses eines Index aus geschätzten Zuchtwerten und Genauigkeit auf genetischen Fortschritt und Nützlichkeit wurde durch stochastische Simulation durchgeführt. Es wurden zwei Populationstypen untersucht, die einen Bereich von 0–1 (A) in der Genauigkeit oder 0.5–1 (B) haben. Fünfhundert Wiederholungen wurden zur Bewertung des Stichprobendurchschnitts hinsichtlich Erfolg und Varianz durchgeführt. Die Indexgewichtung, die zu einem Plateau innerhalb 1% bzw. 5% des Maximalfortschrittes führte, wurde identifiziert und ließ darauf schließen, daß für Populationen des Typus A und B minimaler Erfolgsverlust vorhanden ist, wenn Gewichtungen der Genauigkeit von bis zu ± 0,5 und ± 1,5 σ ausgewählt wurden. Diese Gewichtungen resultierten in relativ geringfügigen Änderungen in der Rangierung von Tieren, besonders bei geringer Zahl von Kandidaten. Nützlichkeit wurde als eine Funktion von Mittelwert und Varianz des Stichprobenerfolges betrachtet. Indexgewichtungen für maximale Nützlichkeit wurden für sieben Nützlichkeitsfunktionen (drei Risikoabwendungen, drei Risikoerwählungen und eine risikoneutrale Funktion) identifiziert. Eine gewisse Gewichtung der Genauigkeit bei Selektionsentscheidungen kann mit wenig Verminderung des erwarteten mittleren Erfolges vorgenommen werden, so daß Risikobevorzugungen oder Risikoabwendungen durch Veränderung negativer oder positiver Gewichtungen der Genauigkeit möglich und überlegenswert sind. Allerdings scheint es, daß eher extreme Nützlichkeitsfunktionen vorhanden sein müssen, bevor diese Änderung
ISSN:0931-2668
DOI:10.1111/j.1439-0388.1993.tb00712.x
出版商:Blackwell Publishing Ltd
年代:1993
数据来源: WILEY
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2. |
Multitrait restricted and desired gains selection indices designed to change growth and body composition in mice1 |
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Journal of Animal Breeding and Genetics,
Volume 110,
Issue 1‐6,
1993,
Page 13-29
E. J. Eisen,
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摘要:
SummaryEffectiveness of restricted and desired gains index selection to change growth and body composition was tested in mice. Replicate lines were selected within full‐sib families as follows: RI, restricted index to increase 12‐week body weight (BW) and hind carcass weight (HC) with no change in right epididymal fat pad weight (EF); DG, desired gains index to increase BW and HC and decrease EF and right subcutaneous fat pad weight (SF) in designated proportions; RS, random selection. Realized heritabilities of index units, converted to an individual basis, were 0.65 ± 0.17 in RI and 0.50 ± 0.23 in DG, which exceeded the respective base population estimates of 0.32 ± 0.11 and 0.37 ±0.11, calculated as twice the regression of son on sire. Realized genetic correlation between the two selection index units of 0.87 ± 0.12 was not significantly different from the base population estimate of 0.91 ± 0.21. Realized correlated responses in component traits of the indices did not agree closely with expectation. Possible explanations for these discrepancies include genetic drift, weak selection intensity, discrepancies between estimated and true genetic parameters and changes in genetic parameters due to selection. Antagonistic selection for multiple traits may magnify the importance of these factors.ZusammenfassungRestringierte und erwünschte genetische Fortschritte zur Veränderung von Wachstum und Körperzusammensetzung von MäusenDie Wirksamkeit restraingierter und erwünschter Fortschritt‐Indexselektionsveränderung von Wachstum und Körpergewicht wurde bei Mäusen geprüft. Wiederholungslinien wurden innerhalb Vollgeschwisterfamilien folgendermaßen selektiert: RI, restringierter Index zur Steigerung des 12‐Wochengewichtes (BW), Schlachtkörperhälfte (HC) ohne Änderung des rechten Nebenhodenfettgewichts (EF); TG, erwünschter Zuchtfortschrittindex zur Steigerung von BW und HC und Verminderung von EF des rechten subkutanen Fettanteils (SF) in erwünschten Verhältnissen; RS Zufallsselektion. Realisierte Heritabilitätswerte im Index, auf individuelle Basis umgerechnet, waren 0,65 ±0,17 bei RI und 0,50 ± 0,23 bei DG, die die diesbezüglichen Basispopulationsschätzungen von 0,23 ±0,11 und 0,37 ±0,11 übertrafen. Diese wurden als die doppelte Regression von Sohn auf Vatertier berechnet. Realisierte genetische Korrelationen zwischen den zwei Selektionsindexeinheiten von 0,87 unterschieden sich nicht signifikant vom Basispopulationswert 0,91 ± 0,21. Realisierte korrelierte Selektion‐sreaktionen in den Teilmerkmalen der Indices haben mit den Erwartungswerten nicht gut übereingestimmt. Mögliche Erklärung für diese Abweichung beinhalten genetische Drift, schwache Selektionsintensität, Nichtübereinstimmung zwischen geschätzten und wahren genetischen Parametern und Veränderungen in diesen durch Selektion. Antagonistische Selektion für mehrere Merkm
ISSN:0931-2668
DOI:10.1111/j.1439-0388.1993.tb00713.x
出版商:Blackwell Publishing Ltd
年代:1993
数据来源: WILEY
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3. |
Optimized testing schemes using nucleus progeny, adult MOET siblings, or juvenile MOET pedigrees in dairy cattle closed populations |
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Journal of Animal Breeding and Genetics,
Volume 110,
Issue 1‐6,
1993,
Page 30-40
O. L. Bondoc,
Ch. Smith,
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摘要:
SummarySelection response rates are predicted for nucleus progeny testing, adult multiple ovulation and embryo transfer (MOET) sib testing, and juvenile MOET pedigree testing in closed populations. Deterministic models are adapted to adjust predicted genetic gains for the effects of population size and structure, selection disequilibrium, sampling losses, and inbreeding depression. The improvement schemes were optimized for different numbers of sires used and first lactation females recorded per year. The number of nucleus daughters tested per sire, and of females per MOET full sibship, that maximize the predicted response to selection per year, were determined. Annual genetic gains and inbreeding rates were interpolated to the same planning horizon (20 years) to compare the optimized schemes for a wide range of situations.The predicted maximum genetic gain per year is higher for adult MOET than for juvenile MOET (due to the proportional extra time to collect the embryos needed) and for nucleus progeny testing. Average annual inbreeding rates are much higher for MOET schemes than for nucleus progeny testing. The advantages of adult and juvenile over nucleus progeny testing are little affected by planning horizon, but are higher with more females recorded per year, higher heritability, and higher reproductive and MOET success rates. Comparison of the schemes at the same level of inbreeding is fairer for fixed testing resources. At the same inbreeding level, the genetic advantage of adult MOET was generally maintained, but juvenile MOET then lost its advantage over progeny testing in these closed populations.ZusammenfassungOptimierte Prüfpläne für Nukleusnachkommen, adulte MOET Geschwister oder juvenile MOET Pedigrees in geschlossenen MilchviehpopulationenSelektionserfolge werden für Nukleusnachkommenprüfung, adulte multiple Ovulation (MOET) und Embryotransfer, Geschwisterprüfung und juvenile MOET Pedigreeprüfung geschlossener Populationen geschätzt. Deterministische Modelle werden modifiziert zur Berücksichtigung geschätzter genetischer Fortschritte für die Wirkungen von Populationsgröße, Struktur, Selektionsungleichgewicht, Stichprobenungenauigkeit und Inzuchtdepression. Die Zuchtpläne werden für verschiedene Zahlen von Stieren und Erstlaktationskühe pro Jahr optimiert. Die Zahl der geprüften Nukleustöchter je Stier und Kühe je MOETVollgeschwistergruppe, die den geschätzten Erfolg maximieren, werden bestimmt. Um die optimierten Pläne über einen weiten Bereich zu vergleichen, werden jährlicher Zuchtfortschritt und Inzuchtzuwachs für den gleichen Planungshorizont von 20 Jahren interpoliert.Der geschätzte maximale Zuchtfortschritt pro Jahr ist für adultes MOET höher als bei juvenilem (wegen zusätzlicher Zeit zur Embryonengewinnung) und bei Nukleusnachkommenschaftsprüfung. Durchschnittliche jährliche Inzuchtraten sind viel höher für MOET Pläne als für das Nachkommenschaftsprüfsystem. Die Vorteile des adulten und juvenilen MOET über Nukleusnachkommenprüfung werden durch den Planungshorizont nur geringfügig tangiert, werden aber höher, wenn mehr weibliche Tiere je Jahr geprüft werden bei höherer Heritabilität, höherer Reproduktions‐ und Erfolgsrate. Der Vergleich der Pläne beim gleichen Inzuchtnivea
ISSN:0931-2668
DOI:10.1111/j.1439-0388.1993.tb00714.x
出版商:Blackwell Publishing Ltd
年代:1993
数据来源: WILEY
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4. |
Effects of strains, strain crosses and environments on additive genetic and phenotypic variances inDrosophila melanogaster |
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Journal of Animal Breeding and Genetics,
Volume 110,
Issue 1‐6,
1993,
Page 41-56
R. R. Noor,
J. S. F. Barker,
B. P. Kinghorn,
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PDF (1091KB)
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摘要:
SummaryThe stability of phenotypic, additive genetic and environmental variances of thorax length ofDrosophila melanogasterin pure and synthetic strains was examined in two different environments. Two pure strains from different geographic locations (Melbourne and Townsville) were used, together with three synthetic populations formed from them.The existence of differences in thorax length between the Melbourne and Townsville populations, genotype by environment interaction, and heterosis in crosses between these populations indicate that they are genetically different. Thus geographic separation can cause differences in mean thorax length of flies from different populations. Both the difference in selection histories between the two localities and drift could lead to these differences. Up to the thirty fifth generation there was no evidence of any reduction in the difference between the Melbourne and Townsville populations, in either laboratory environment. The genetic differentiation of strains therefore may be maintained over many generations under new environmental conditions.The fluctuation over generations of heterosis of thorax length is possibly caused by the fluctuation of the rate of loss of favourable epistatic interaction in crossbred genotypes in combination with natural selection effects.Vpwas significantly higher in poor than in the good environment. This higher Vpin the poor environment is most likly due to higher non additive genetic variance. Vpwas also significantly influenced by strain. In general, Vpvalues of synthetic strains were higher than those of pure strains in both environments.Finally, the additive and environmental variances of thorax length were relatively stable across strains, generations and environments.ZusammenfassungWirkung von Herkünften, Kreuzungen und Umwelten auf additiv‐genetische und phänotypische Varianzen in Drosophila melanogasterDie Stabilität phänotypischer, additiv‐genetischer und umweltbedingter Varianzen der Thoraxlänge von Drosophila melanogaster in reinen und synthetischen Herkünften wurde in zwei verschiedenen Umwelten überprüft. Zwei reine Herkünfte von verschiedenen Gegenden (Melboune und Townsville) wurden zusammen mit drei zwischen ihnen gebildeten synthetischen Populationen untersucht.Unterschiede in Thoraxlänge zwischen Melbourne‐ und Townsvilleherkünften, Genotypumweltinteraktionen und Heterosis in Kreuzungen zwischen diesen Populationen zeigen, daß sie sich genetisch unterscheiden. Die geographische Trennung kann also Unterschiede in der mittleren Thoraxlänge zur Folge haben, wobei unterschiedliche Selektionsgeschichte in beiden Gegenden und Drift dies verursachen können. Bis zur 35. Generation gab es in keinem Labormilieu einen Hinweis auf eine Reduktion der Unterschiede zwischen den beiden Populationen. Die genetische Differenz der Herkünfte erhält sich daher auch unter neuen Umweltverhältnissen über viele Generationen.Die Schwankung in Heterosis für Thoraxlänge ist möglicherweise durch Schwankungen in der Verlustrate günstiger epistatischer Interaktionswirkungen in Kreuzungsgenotypen zusammen mit natürlichen Selektionswirkungen verursacht.Vpwar durch Umweltbedingungen signifikant beeinflußt und höher in schlechtem als in gutem Milieu. Der hohe Wert in schlechtem Milieu ist wahrscheinlich auf nicht‐additiv‐genetische Varianz zurückzuführen. Vpwurde auch signifikant durch Herkunft beeinflußt und Werte in synthetischen Linien waren höher Linien in beiden Milieus. Additive und umweltbedingte Varianzen waren über Linie,
ISSN:0931-2668
DOI:10.1111/j.1439-0388.1993.tb00715.x
出版商:Blackwell Publishing Ltd
年代:1993
数据来源: WILEY
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5. |
A theoretical comparison between direct and indirect conversions of dairy bull evaluations |
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Journal of Animal Breeding and Genetics,
Volume 110,
Issue 1‐6,
1993,
Page 57-65
G. Banos,
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PDF (569KB)
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摘要:
SummarySimulated data were used to compare direct and indirect conversions of bull evaluations in the presence of selection. In the case of indirect conversion, when bulls used to calculate conversions from the exporting to the intermediate country were first tested in the exporting country, indirect conversions resulted in unbiased predicted evaluations. When these bulls were first tested in the intermediate country and were selected on their estimated breeding value, indirect conversions overestimated predicted evaluations in the importing country. In all cases the prediction error variance was consistently higher for indirect than for direct conversions. Indirect conversions could be used only if there are no adequate common bulls in two countries; caution should be exercised when choosing the intermediate country.ZusammenfassungTheoretischer Vergleich zwischen direkten und indirekten Konversionen von MilchtierhewertungenEs wurden simulierte Daten zum Vergleich direkter und indirekter Konversionen von Nachkommenschaftsprüfergebnissen bei Selektion verwendet. Wenn Stiere zur Berechnung der Konversionen von Export zu Mittlerländern zuerst in Exportländern geprüft worden waren, resultierten indirekte Konversionen in unverzerrten Prädiktionen. Bei Nachkommenschaftsprüfung in Mittlerländern und bei Selektion auf der Basis des geschätzten Zuchtwertes überschätzten indirekte Konversionen die Werte in Importländern. In allen Fällen war die Varianz der Prädiktion bei indirekter höher als bei direkter Konversion. Indirekte Konversionen sollten nur verwendet werden, wenn keine Vergleichsbullen in zwei Ländern vorhanden sind. Vorsicht sollte bei der Wahl in Mittlerländer
ISSN:0931-2668
DOI:10.1111/j.1439-0388.1993.tb00716.x
出版商:Blackwell Publishing Ltd
年代:1993
数据来源: WILEY
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6. |
About camel breeds: A reevaluation of current classification systems |
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Journal of Animal Breeding and Genetics,
Volume 110,
Issue 1‐6,
1993,
Page 66-73
Ilse Köhler‐Rollefson,
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PDF (618KB)
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摘要:
SummaryThis article revaluates the current dromedary breed classifications based on Leese's(1927) division into hills, riverine and plains camel according to camel breeding zones, and the even earlier distinction by Cross(1917) and Leonard(1894) between baggage and riding camels. It is suggested that these classifications are inappropriate to portray the wide variety of camel breeds actually existing, since they do not accurately reflect the ecological context of camel breeding and also depict incompletely the actual uses to which camels are put in camel pastoral societies. The breeding practices of traditional camel pastoral societies are described and discussed, and it is concluded that these have been conducive to the development of a large number of specialized camel breeds. It is pointed out that many camel breeds are endangered, and that it is imperative to take steps for their documentation.ZusammenfassungKamelrassen: Revision des gegenwärtigen KlassifikationssystemsIn diesem Artikel werden die heute gebräuchlichen Klassifikationssysteme für Dromedarrassen einer Prüfung unterzogen: Diese beruhen auf der Einteilung von Leese(1927) nach Kamelzuchtgebieten in Berg‐, Fluß‐ und Flachlandkamele und der noch älteren Unterscheidung von Cross(1917) und Leonard(1894) zwischen Reit‐ und Lastkamelen. Es wird vorgeschlagen, daß diese Einteilungen der tatsächlichen Variabilität zwischen Kamelrassen nicht gerecht werden, weil sie die ökologischen Bedingungen, unter denen Kamelzucht betrieben wird, nicht richtig reflektieren und die tatsächlichen Nutzungsweisen, denen das Kamel in Kamelhirtenkulturen unterzogen wird, nur unvollständig wiedergeben. Die Zuchtmethoden traditioneller Kamelhirten werden beschrieben und diskutiert, und es wird die Schlußfolgerung gezogen, daß diese für die Herausbildung vieler spezialisierter Rassen ideale Vorbedingungen darstellten. Auf die große Gefahr des Verlustes vieler dieser Rassen und die Notwendigkeit diese zu katalogisi
ISSN:0931-2668
DOI:10.1111/j.1439-0388.1993.tb00717.x
出版商:Blackwell Publishing Ltd
年代:1993
数据来源: WILEY
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7. |
Assortative mating and directional or stabilizing selection for a non‐linear function of traits inTribolium |
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Journal of Animal Breeding and Genetics,
Volume 110,
Issue 1‐6,
1993,
Page 74-80
J. L. Campo,
M. García Gil,
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PDF (505KB)
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摘要:
SummaryAssortative or random mating following selection in either direction on a non‐linear index (experiment 1) or stabilizing selection for pupal length (experiment 2) were carried out for five generations in two lines ofTribolium castaneum(A and R, respectively), with three replicates each. The selected proportion was 25% in all lines. In experiment 1, the selection criterion was designed to increase the aggregate value of adult weight and the first‐ and second‐order powers of pupal length. The A and R lines gave significant responses for the aggregate value (184 ± 6 and 161 ± 14, respectively), pupal length (0.74 ± 0.02 and 0.64 ± 0.05, respectively), and adult weight (0.79 ± 0.03 and 0.78 ± 0.12, respectively). Although the A line was not significantly better than the R line, there was a consistent advantage for assortative mating over random mating, the mean response for aggregate value and pupal length being approximately 1.15 times greater for the A line. In experiment 2 the selection criterion was the square of the deviation from the mean pupal length (stabilizing selection); both lines did not show any change for pupal length. The phenotypic variance showed a significant decrease in the A and R lines, due to a decrease in between‐family variance. The assortatively and randomly mated lines were similar for these changes in phenotypic variation.ResumenAparemiento clasificado y selección direccional o estabilizante para una función no lineal en Tribolium.Dos líneas deTribolium castaneumfueron seleccionadas direccionalmente para un índice no lineal (experimento 1) o estabilizantemente para longitud de pupa (experimento 2), apareando los animales seleccionados clasificadamente (A) o aleatoriamente (R). Había tres repeticiones por experimento y línea, siendo la proporción de selección el 25%. En el experimento 1, el objetivo de selección incluía el peso adulto así como la longitud de pupa y su cuadrado. Ambas líneas dieron respuesta significativa para el valor agregado y sus dos caracteres componentes. Había una ventaja consistente aunque no significativa para el apareamiento clasificado, siendo la respuesta media para valor agregado y longitud de pupa 1.15 veces mayor en la línea A. En el experimento 2, el criterio de selección era el cuadrado de la desviación con respecto a la media de longitud de pupa (selección estabilizante); ambas líneas no mostraron ningún cambio significativo en longitud de pupa. La varianza fenotípica tuvo una disminución significativa debida a una reducción de la varianza genética, siendo estos cambios similares en ambas líneas.ZusammenfassungAssortative Paarung, gerichtete oder stabilisierende Selektion für nicht‐lineare Funktion von Merkmalen in TriboleumAssortative oder Zufallspaarung nach gerichteter Selektion in beiden Richtungen für nicht‐lineare Merkmale (Versuch 1) oder stabilisierende für Puppenlänge (Versuch 2) wurden über 5 Generationen bei Triboleum castaneum (A bzw. R), mit je 3 Wiederholungen und 25% Remonte, durchgeführt. In Versuch 1 sollten adultes Gewicht und 1. und 2. Potenz der Puppenlänge gesteigert werden. A und R Linien ergaben signifikante Selektionserfolge für Gesamtwert (184 ± 6 bezw. 161 ± 14), Puppenlänge (0,74 ± 02, 0.64 ± 05) und adultes Gewicht (0.74 ± 03 und 0.78 ± 0.12). Obwohl Linie A nicht statistisch signifikant überlegen war, zeigte sich durchgehend überlegenheit gegenüber R Linien, im Durchschnitt 1,15 mal. In Versuch 2 zeigte keine der beiden Linien Veränderungen der Puppenlänge, aber die Varianz nahm signifikant ab wegen Verminderung der Varianz zwischen Familien, deren Abnahme in der zufalls‐ und in der assortativ gepaarten Linie gleich groß war.RésuméAccouplement classé et sélection directionelle o stabilisant pour une fonction no lineal chez TriboliumDeux lingnées deTribolium castaneumon été soumis a sélection directionelle par un index no lineal (Expérience 1) o stabilisant pour la longeur de la pupae (Expérience 2), avec accouplement des animaux sélectiones de façon classé (A) ou aléatoire (R). Le travail compris 3 répétitions pour chacune des expériences et lignée, avec une presion de sélection du 25%. Dans l'expérience 1 l'objetive de sélection était composé pour le poids adult, la longeur de la pupae et sa carrée. On a obtenû une réponse significative chez les deux lignées por l'agregé et aussi pour les deux caractéres. On a obtenû une superiorité no significative mais consistant de l'accouplement classé, étant la réponse moyenne pour l'agregé et la longeur de la pupae 1.15 fois plus grand chez la lignée A. Pour l'experience 2 le critére de selection etait le carrée de la deviation a la moyenne de la longeur de la pupae (sélection stabilisant); aucune des lignees montrait changes significatives pour la longeur de la pupae. La variation phénotypique montre une réduction si
ISSN:0931-2668
DOI:10.1111/j.1439-0388.1993.tb00718.x
出版商:Blackwell Publishing Ltd
年代:1993
数据来源: WILEY
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8. |
Solution of multiple trait animal models with missing data on some traits |
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Journal of Animal Breeding and Genetics,
Volume 110,
Issue 1‐6,
1993,
Page 81-92
V. Ducrocq,
B. Besbes,
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摘要:
SummaryIn multiple trait animal model evaluations, several transformations (canonical, triangular, combined) can be used to decrease the size of the mixed model equations or to increase their sparsity. A simple method based on an EM argument and replacing missing records by their expectation given the current parameters allows the use of the canonical transformation in situations where data are missing and selection is ignorable. The convergence behavior of these different approaches were compared on real data sets simulating different missing patterns. The combined transformation is always better than the triangular transformation. The extended version of the canonical transformation clearly leads to the fastest convergence, in terms of overall CPU time, especially when a reduced animal model is used (2 to 3 times faster than the triangular transformation) and when more traits are considered simultaneously.RésuméSolution des modèles animales multicaractères avec fichiérs manquantesDans les évaluations multicaractères de type modèle animal, diverses transformations (canonique, triangulaire, combinée) peuvent être utilisées pour diminuer la taille du système d'équations du modèle mixte ou pour en accroître le nombre d'éléments nuls. Une méthode simple basée sur un raisonnement de type EM et remplaçant les données manquantes par leur espérance sachant la valeur courante des paramètres permet l'utilisation de la transformation canonique dans des situations avec données manquantes et où le processus de sélection peut être ignoré. Les vitesses de convergence de ces différentes approches ont été comparées ` partir de fichiers réels simulant différent types de données manquantes. La transformation combinée s'est revelée toujours meilleure que la transformation triangulaire. La version étendue de la transformation canonique conduit clairement ` la convergence la plus rapide, tout spécialement quand un modèle animal réduit est utilisé (2 ` 3 fois plus rapide que la transformation triangulaire) et quand un grand nombre de caractères sont considérés simultanément.ZusammenfassungLósung bei Mehrmerkmalsmodellen und teilweise fehlenden Daten bei einzelnen MerkmalenBeim Mehrmerkmal‐Tiermodell können mehrere Transformationen (kanonisch, Winkel, kombiniert) zur Reduktion der Gleichungszahl oder zur Steigerung der null Elemente verwendet werden. Eine einfache Methode, die auf EM‐Schlußfolgerungen beruht und fehlende Beobachtungen mit ihren Erwartungswerten (aufgrund gegebener Parameter) ersetzt, gestattet Verwendung kanonischer Transformation bei teilweise fehlenden Daten und vernachlässigbarer Selektion. Das Konvergenzverhalten verschiedener Ansätze wurde an realem Datenmaterial mit simulierten Fehlmustern verglichen. Die erweiterte Transformation ist immer besser als die Winkeltransformation, und diese kanonische Transformation führt hinsichtlich CPU‐Zeit zur schnellsten Konvergenz, besonders wenn ein reduziertes Tiermodell mit mehreren Merkmalen verwende
ISSN:0931-2668
DOI:10.1111/j.1439-0388.1993.tb00719.x
出版商:Blackwell Publishing Ltd
年代:1993
数据来源: WILEY
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9. |
Estimation of variance components with dominance and inbreeding in dairy cattle |
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Journal of Animal Breeding and Genetics,
Volume 110,
Issue 1‐6,
1993,
Page 93-104
I. Hoeschele,
A. R. Vollema,
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PDF (697KB)
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摘要:
SummaryThe five variance components in the genetic (co)variance among inbred relatives for a quantitative trait with additive and dominance genetic variation were estimated by equating variances among and within different types of families of inbred cows to their expectations. The data used were milk and fat yields of 85,433 U.S. Holstein cows with inbreeding coefficients of 6.25% or higher. When all five parameters were estimated, unrealistic results were obtained. If all quantitative trait loci are biallelic, genetic (co)variance depends on only four parameters. More realistic estimates were obtained under this assumption. There was a substantial negative covariance among breeding values and dominance effects under inbreeding, and the dominance variance in inbred cows was larger than the dominance variance in the noninbred base population.ZusammenfassungVarianzkomponenteneinschätzung bei Dominanz und Inzucht von MilchviehDie fünf Varianzkomponenten in der genetischen (Ko)Varianz zwischen ingezüchteten Verwandten in einem quantitativen Merkmal wurden geschätzt durch Gleichsetzen von Varianzen zwischen und innerhalb verschiedener Familien von ingezüchteter Kühen zu ihren Erwartungswerten. Das Datenmaterial bestand aus den Milch‐ und Fettmengen von 85,433 U.S. Holstein Kühen mit Inzuchtkoeffizienten von 6.25% oder höher. Die gleichzeitige Schätzung aller fünf Parameter führte zu unrealistischen Ergebnissen. Wenn an allen Genorten des quantitativen Merkmals nur zwei Allele vorkommen, gehen nur vier Parameter in die genetische (Ko)Varianz ein. Die Schätzwerte, die unter dieser Annahme berechnet wurden, waren plausibler. Eine beträchtliche negative Kovarianz zwischen den Zuchtwerten und den Dominanzwerten bei Inzucht wurde gefunden, und die Dominanzvarianz war unter Inzucht gróßer als in der
ISSN:0931-2668
DOI:10.1111/j.1439-0388.1993.tb00720.x
出版商:Blackwell Publishing Ltd
年代:1993
数据来源: WILEY
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10. |
Animal model estimation of non‐additive genetic parameters in dairy cattle, and their effect on heritability estimation and breeding value prediction |
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Journal of Animal Breeding and Genetics,
Volume 110,
Issue 1‐6,
1993,
Page 105-113
Y. Akbas,
Susan Brotherstone,
W. G. Hill,
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PDF (550KB)
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摘要:
SummaryFirst lactation production records of pedigree Holstein‐Friesian cows in the UK were analysed by an animal model, in order to estimate effects of heterosis and recombination loss between North American Holstein and European Friesian cattle and the influence of these effects on breeding value prediction. Coefficients of heterosis and recombination loss were fitted in the animal model as covariables and unknown parents were assigned to a varying number of genetic groups.The estimates of heterosis effects were 104 kg, 4.3 kg and 2.9 kg for milk, fat and protein yield, respectively, while the corresponding coefficients for recombination loss were −135 kg, −2.6 kg and −3.7 kg respectively. Neither the sire component of variance nor the heritability estimates were appreciably affected by the inclusion of heterosis and recombination loss in the model. Including both these effects in the breeding value estimation increased the predicted sire proof for fat plus protein of a typical F1 Holstein × Friesian sire by 3 kg.ZusammenfassungTiermodellschätzungen nicht‐additiv genetischer Parameter bei Milchrindern und ihre Auswirkung auf Heritabilitätsschätzung und ZuchtwertvoraussageLaktationsleistungen von Herdbuch Holstein‐Friesen Kühen im UK wurden mittels eines Tiermodells analysiert zur Schätzung der Wirkungen von Heterosis und Rekombinationsverlust zwischen nordamerikanischen Holstein und europäischen Schwarzbunten und Einfluß dieser Wirkungen auf Zuchtwahlvorhersagen. Koeffizienten für Heterosis und für Rekombinationsverlust wurden im Tiermodell als Co‐Variable berücksichtigt und unbekannte Eltern einer unterschiedlichen Zahl genetischer Gruppen zugeordnet.Schätzungen der Heterosiswirkungen waren 104 kg, 4,3 kg und 2,1 kg für Milch‐, Fett‐ Proteinmengen, während die diesbezüglichen Koeffizienten für Rekombinationsverlust −135, −2,6 und −3,7 kg waren. Weder die Vatervarianzkomponente noch Heritabilitätswerte wurden durch Berücksichtigung von Heterosis und Rekombinationsverluste im Modell tangiert. Berücksichtigung beider Wirkungen in der Zuchtwertschätzung erhöhte den geschätzten Vaterzuchtwert für Fett + Protein eine
ISSN:0931-2668
DOI:10.1111/j.1439-0388.1993.tb00721.x
出版商:Blackwell Publishing Ltd
年代:1993
数据来源: WILEY
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